Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB3BPQ13352 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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ITGB3BPQ13352 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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ITGB3BPQ13352 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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ITGB3BPQ13352 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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ITGB3BPQ13352 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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ITGB3BPQ13352 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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ITGB3BPQ13352 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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ITGB3BPQ13352 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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ITGB3BPQ13352 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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ITGB3BPQ13352 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB3BPQ13352 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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