Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SKP2Q13309 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SKP2Q13309 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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