Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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