Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCAPQ12770 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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