Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms