Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms