Protein–RNA interactions for Protein: Q02543

RPL18A, 60S ribosomal protein L18a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18AQ02543 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPL18AQ02543 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms