Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms