Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNFRSF17Q02223 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms