Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms