Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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H3F3AP84243 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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H3F3AP84243 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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H3F3AP84243 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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H3F3AP84243 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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