Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPNP63162 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms