Protein–RNA interactions for Protein: P63146

UBE2B, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 B, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2BP63146 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2BP63146 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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