Protein–RNA interactions for Protein: P62917

RPL8, 60S ribosomal protein L8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL8P62917 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPL8P62917 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPL8P62917 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPL8P62917 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPL8P62917 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPL8P62917 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPL8P62917 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPL8P62917 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPL8P62917 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPL8P62917 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPL8P62917 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPL8P62917 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPL8P62917 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPL8P62917 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPL8P62917 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPL8P62917 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPL8P62917 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPL8P62917 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPL8P62917 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPL8P62917 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPL8P62917 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RPL8P62917 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPL8P62917 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RPL8P62917 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RPL8P62917 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPL8P62917 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPL8P62917 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPL8P62917 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPL8P62917 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RPL8P62917 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RPL8P62917 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RPL8P62917 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RPL8P62917 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RPL8P62917 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPL8P62917 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RPL8P62917 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPL8P62917 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPL8P62917 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPL8P62917 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPL8P62917 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPL8P62917 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPL8P62917 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RPL8P62917 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPL8P62917 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPL8P62917 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPL8P62917 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RPL8P62917 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPL8P62917 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPL8P62917 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RPL8P62917 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPL8P62917 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPL8P62917 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPL8P62917 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPL8P62917 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPL8P62917 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPL8P62917 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPL8P62917 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPL8P62917 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPL8P62917 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPL8P62917 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPL8P62917 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPL8P62917 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPL8P62917 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPL8P62917 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPL8P62917 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPL8P62917 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPL8P62917 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPL8P62917 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RPL8P62917 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPL8P62917 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPL8P62917 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPL8P62917 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPL8P62917 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPL8P62917 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPL8P62917 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPL8P62917 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPL8P62917 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPL8P62917 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPL8P62917 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPL8P62917 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPL8P62917 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPL8P62917 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPL8P62917 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPL8P62917 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPL8P62917 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPL8P62917 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPL8P62917 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPL8P62917 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPL8P62917 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPL8P62917 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPL8P62917 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPL8P62917 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPL8P62917 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPL8P62917 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RPL8P62917 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RPL8P62917 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RPL8P62917 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RPL8P62917 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RPL8P62917 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
RPL8P62917 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms