Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB15P59190 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB15P59190 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB15P59190 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB15P59190 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB15P59190 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB15P59190 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB15P59190 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB15P59190 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB15P59190 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB15P59190 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB15P59190 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB15P59190 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB15P59190 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB15P59190 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB15P59190 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB15P59190 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB15P59190 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB15P59190 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB15P59190 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB15P59190 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB15P59190 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB15P59190 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB15P59190 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB15P59190 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB15P59190 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB15P59190 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB15P59190 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB15P59190 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB15P59190 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB15P59190 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB15P59190 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB15P59190 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB15P59190 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB15P59190 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB15P59190 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB15P59190 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB15P59190 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB15P59190 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB15P59190 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB15P59190 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB15P59190 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB15P59190 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB15P59190 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB15P59190 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB15P59190 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB15P59190 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB15P59190 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB15P59190 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB15P59190 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms