Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA9P57773 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA9P57773 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA9P57773 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA9P57773 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA9P57773 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA9P57773 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA9P57773 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA9P57773 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA9P57773 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA9P57773 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA9P57773 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA9P57773 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA9P57773 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA9P57773 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA9P57773 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA9P57773 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA9P57773 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA9P57773 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA9P57773 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA9P57773 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA9P57773 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA9P57773 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA9P57773 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA9P57773 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA9P57773 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA9P57773 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA9P57773 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA9P57773 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA9P57773 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA9P57773 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA9P57773 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA9P57773 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA9P57773 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA9P57773 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA9P57773 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA9P57773 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA9P57773 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA9P57773 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA9P57773 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA9P57773 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA9P57773 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJA9P57773 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJA9P57773 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJA9P57773 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GJA9P57773 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJA9P57773 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJA9P57773 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJA9P57773 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJA9P57773 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJA9P57773 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJA9P57773 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJA9P57773 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJA9P57773 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJA9P57773 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJA9P57773 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJA9P57773 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJA9P57773 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJA9P57773 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJA9P57773 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJA9P57773 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJA9P57773 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJA9P57773 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJA9P57773 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJA9P57773 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJA9P57773 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJA9P57773 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJA9P57773 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJA9P57773 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJA9P57773 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJA9P57773 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJA9P57773 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJA9P57773 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJA9P57773 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJA9P57773 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJA9P57773 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJA9P57773 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJA9P57773 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJA9P57773 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJA9P57773 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJA9P57773 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJA9P57773 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJA9P57773 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GJA9P57773 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJA9P57773 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJA9P57773 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJA9P57773 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GJA9P57773 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GJA9P57773 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJA9P57773 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GJA9P57773 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJA9P57773 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GJA9P57773 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJA9P57773 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GJA9P57773 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJA9P57773 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJA9P57773 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJA9P57773 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJA9P57773 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJA9P57773 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms