Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP107P57740 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP107P57740 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP107P57740 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP107P57740 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP107P57740 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP107P57740 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP107P57740 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP107P57740 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP107P57740 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP107P57740 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP107P57740 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP107P57740 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP107P57740 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP107P57740 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP107P57740 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP107P57740 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP107P57740 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP107P57740 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP107P57740 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP107P57740 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP107P57740 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP107P57740 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP107P57740 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP107P57740 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP107P57740 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP107P57740 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP107P57740 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP107P57740 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP107P57740 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP107P57740 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP107P57740 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP107P57740 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP107P57740 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP107P57740 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP107P57740 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP107P57740 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP107P57740 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP107P57740 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP107P57740 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP107P57740 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP107P57740 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP107P57740 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP107P57740 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP107P57740 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP107P57740 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP107P57740 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP107P57740 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP107P57740 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP107P57740 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP107P57740 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP107P57740 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP107P57740 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP107P57740 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP107P57740 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP107P57740 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP107P57740 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP107P57740 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP107P57740 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP107P57740 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP107P57740 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP107P57740 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP107P57740 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP107P57740 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP107P57740 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP107P57740 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP107P57740 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP107P57740 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP107P57740 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP107P57740 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP107P57740 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP107P57740 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP107P57740 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP107P57740 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP107P57740 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP107P57740 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP107P57740 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP107P57740 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP107P57740 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP107P57740 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP107P57740 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP107P57740 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP107P57740 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms