Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIPK4P57078 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIPK4P57078 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RIPK4P57078 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RIPK4P57078 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIPK4P57078 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RIPK4P57078 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RIPK4P57078 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RIPK4P57078 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
RIPK4P57078 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RIPK4P57078 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RIPK4P57078 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIPK4P57078 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIPK4P57078 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIPK4P57078 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RIPK4P57078 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIPK4P57078 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RIPK4P57078 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIPK4P57078 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIPK4P57078 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIPK4P57078 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIPK4P57078 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIPK4P57078 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIPK4P57078 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIPK4P57078 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIPK4P57078 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIPK4P57078 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIPK4P57078 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIPK4P57078 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIPK4P57078 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RIPK4P57078 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RIPK4P57078 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIPK4P57078 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIPK4P57078 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RIPK4P57078 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RIPK4P57078 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIPK4P57078 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RIPK4P57078 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RIPK4P57078 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
RIPK4P57078 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RIPK4P57078 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RIPK4P57078 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RIPK4P57078 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RIPK4P57078 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIPK4P57078 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RIPK4P57078 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIPK4P57078 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RIPK4P57078 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RIPK4P57078 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RIPK4P57078 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIPK4P57078 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIPK4P57078 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RIPK4P57078 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RIPK4P57078 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIPK4P57078 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RIPK4P57078 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIPK4P57078 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIPK4P57078 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIPK4P57078 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RIPK4P57078 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIPK4P57078 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RIPK4P57078 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RIPK4P57078 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIPK4P57078 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RIPK4P57078 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIPK4P57078 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIPK4P57078 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIPK4P57078 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RIPK4P57078 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RIPK4P57078 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIPK4P57078 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIPK4P57078 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RIPK4P57078 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RIPK4P57078 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIPK4P57078 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIPK4P57078 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RIPK4P57078 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RIPK4P57078 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIPK4P57078 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RIPK4P57078 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RIPK4P57078 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RIPK4P57078 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIPK4P57078 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIPK4P57078 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIPK4P57078 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIPK4P57078 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIPK4P57078 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIPK4P57078 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIPK4P57078 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIPK4P57078 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIPK4P57078 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIPK4P57078 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIPK4P57078 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIPK4P57078 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIPK4P57078 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIPK4P57078 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIPK4P57078 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIPK4P57078 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIPK4P57078 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIPK4P57078 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms