Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FNTAP49354 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FNTAP49354 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FNTAP49354 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FNTAP49354 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FNTAP49354 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FNTAP49354 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FNTAP49354 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNTAP49354 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FNTAP49354 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
FNTAP49354 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNTAP49354 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FNTAP49354 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FNTAP49354 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNTAP49354 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FNTAP49354 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FNTAP49354 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNTAP49354 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNTAP49354 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNTAP49354 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNTAP49354 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNTAP49354 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNTAP49354 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNTAP49354 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNTAP49354 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNTAP49354 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FNTAP49354 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNTAP49354 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNTAP49354 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNTAP49354 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNTAP49354 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNTAP49354 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNTAP49354 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FNTAP49354 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNTAP49354 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNTAP49354 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FNTAP49354 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNTAP49354 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNTAP49354 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNTAP49354 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNTAP49354 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNTAP49354 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNTAP49354 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FNTAP49354 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNTAP49354 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNTAP49354 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FNTAP49354 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNTAP49354 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNTAP49354 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNTAP49354 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNTAP49354 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNTAP49354 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FNTAP49354 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTAP49354 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTAP49354 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTAP49354 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTAP49354 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTAP49354 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTAP49354 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTAP49354 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTAP49354 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTAP49354 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTAP49354 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTAP49354 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTAP49354 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTAP49354 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTAP49354 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTAP49354 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTAP49354 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTAP49354 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTAP49354 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTAP49354 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTAP49354 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTAP49354 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTAP49354 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTAP49354 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTAP49354 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTAP49354 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTAP49354 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTAP49354 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTAP49354 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTAP49354 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTAP49354 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTAP49354 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTAP49354 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FNTAP49354 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTAP49354 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTAP49354 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTAP49354 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTAP49354 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTAP49354 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTAP49354 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTAP49354 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTAP49354 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTAP49354 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTAP49354 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTAP49354 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTAP49354 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTAP49354 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FNTAP49354 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms