Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLCP48506 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLCP48506 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLCP48506 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLCP48506 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLCP48506 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLCP48506 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLCP48506 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLCP48506 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLCP48506 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLCP48506 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLCP48506 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLCP48506 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLCP48506 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLCP48506 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLCP48506 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLCP48506 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLCP48506 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLCP48506 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLCP48506 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLCP48506 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLCP48506 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLCP48506 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLCP48506 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLCP48506 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLCP48506 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLCP48506 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLCP48506 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLCP48506 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLCP48506 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLCP48506 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLCP48506 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLCP48506 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLCP48506 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLCP48506 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLCP48506 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLCP48506 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLCP48506 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLCP48506 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLCP48506 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLCP48506 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLCP48506 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLCP48506 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLCP48506 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLCP48506 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLCP48506 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLCP48506 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLCP48506 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLCP48506 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLCP48506 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLCP48506 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLCP48506 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLCP48506 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLCP48506 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLCP48506 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLCP48506 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLCP48506 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLCP48506 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLCP48506 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLCP48506 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLCP48506 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLCP48506 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLCP48506 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLCP48506 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLCP48506 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLCP48506 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLCP48506 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLCP48506 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLCP48506 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLCP48506 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLCP48506 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLCP48506 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLCP48506 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLCP48506 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLCP48506 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLCP48506 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLCP48506 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLCP48506 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLCP48506 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLCP48506 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLCP48506 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLCP48506 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLCP48506 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLCP48506 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLCP48506 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLCP48506 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLCP48506 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLCP48506 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLCP48506 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLCP48506 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLCP48506 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLCP48506 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLCP48506 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLCP48506 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLCP48506 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLCP48506 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLCP48506 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLCP48506 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLCP48506 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLCP48506 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms