Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRATP43155 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRATP43155 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRATP43155 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRATP43155 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRATP43155 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRATP43155 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRATP43155 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRATP43155 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CRATP43155 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRATP43155 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRATP43155 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRATP43155 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRATP43155 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRATP43155 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRATP43155 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRATP43155 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRATP43155 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRATP43155 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRATP43155 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRATP43155 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRATP43155 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRATP43155 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CRATP43155 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CRATP43155 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CRATP43155 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRATP43155 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRATP43155 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CRATP43155 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRATP43155 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRATP43155 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRATP43155 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRATP43155 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRATP43155 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRATP43155 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRATP43155 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRATP43155 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRATP43155 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRATP43155 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CRATP43155 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CRATP43155 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CRATP43155 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CRATP43155 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRATP43155 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRATP43155 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRATP43155 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRATP43155 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRATP43155 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRATP43155 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRATP43155 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRATP43155 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRATP43155 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRATP43155 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRATP43155 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRATP43155 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRATP43155 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRATP43155 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRATP43155 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRATP43155 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRATP43155 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CRATP43155 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CRATP43155 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRATP43155 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRATP43155 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRATP43155 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRATP43155 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRATP43155 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRATP43155 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRATP43155 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRATP43155 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRATP43155 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRATP43155 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRATP43155 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRATP43155 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRATP43155 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRATP43155 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRATP43155 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRATP43155 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRATP43155 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRATP43155 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRATP43155 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRATP43155 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRATP43155 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRATP43155 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRATP43155 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRATP43155 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CRATP43155 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRATP43155 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRATP43155 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRATP43155 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRATP43155 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRATP43155 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRATP43155 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms