Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHI3L1P36222 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms