Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms