Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms