Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABCD3P28288 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCD3P28288 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABCD3P28288 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCD3P28288 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABCD3P28288 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCD3P28288 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCD3P28288 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCD3P28288 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCD3P28288 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ABCD3P28288 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCD3P28288 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCD3P28288 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCD3P28288 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCD3P28288 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCD3P28288 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCD3P28288 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCD3P28288 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCD3P28288 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ABCD3P28288 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCD3P28288 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCD3P28288 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCD3P28288 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCD3P28288 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCD3P28288 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCD3P28288 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ABCD3P28288 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCD3P28288 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCD3P28288 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ABCD3P28288 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCD3P28288 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCD3P28288 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCD3P28288 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ABCD3P28288 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCD3P28288 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ABCD3P28288 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCD3P28288 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ABCD3P28288 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCD3P28288 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCD3P28288 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCD3P28288 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCD3P28288 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCD3P28288 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCD3P28288 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCD3P28288 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCD3P28288 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCD3P28288 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ABCD3P28288 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ABCD3P28288 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCD3P28288 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCD3P28288 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCD3P28288 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCD3P28288 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCD3P28288 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCD3P28288 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCD3P28288 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCD3P28288 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCD3P28288 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCD3P28288 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCD3P28288 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCD3P28288 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCD3P28288 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCD3P28288 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCD3P28288 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCD3P28288 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCD3P28288 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ABCD3P28288 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCD3P28288 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCD3P28288 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCD3P28288 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCD3P28288 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCD3P28288 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCD3P28288 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCD3P28288 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCD3P28288 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ABCD3P28288 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ABCD3P28288 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ABCD3P28288 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCD3P28288 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCD3P28288 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ABCD3P28288 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCD3P28288 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCD3P28288 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCD3P28288 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCD3P28288 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCD3P28288 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCD3P28288 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCD3P28288 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCD3P28288 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCD3P28288 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCD3P28288 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ABCD3P28288 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCD3P28288 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCD3P28288 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCD3P28288 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCD3P28288 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ABCD3P28288 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ABCD3P28288 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ABCD3P28288 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ABCD3P28288 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms