Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms