Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRKCHP24723 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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