Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms