Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF1P22415 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF1P22415 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF1P22415 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF1P22415 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF1P22415 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF1P22415 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF1P22415 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF1P22415 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF1P22415 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF1P22415 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF1P22415 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
USF1P22415 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
USF1P22415 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF1P22415 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF1P22415 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF1P22415 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF1P22415 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF1P22415 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF1P22415 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
USF1P22415 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
USF1P22415 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF1P22415 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
USF1P22415 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF1P22415 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF1P22415 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF1P22415 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF1P22415 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF1P22415 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF1P22415 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF1P22415 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF1P22415 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF1P22415 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF1P22415 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF1P22415 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF1P22415 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
USF1P22415 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF1P22415 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USF1P22415 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF1P22415 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF1P22415 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF1P22415 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF1P22415 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF1P22415 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF1P22415 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF1P22415 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF1P22415 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF1P22415 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF1P22415 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF1P22415 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF1P22415 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF1P22415 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF1P22415 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF1P22415 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF1P22415 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF1P22415 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF1P22415 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF1P22415 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF1P22415 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF1P22415 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF1P22415 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF1P22415 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF1P22415 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF1P22415 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF1P22415 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF1P22415 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF1P22415 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF1P22415 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF1P22415 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF1P22415 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF1P22415 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF1P22415 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF1P22415 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF1P22415 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF1P22415 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF1P22415 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
USF1P22415 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF1P22415 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF1P22415 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF1P22415 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF1P22415 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF1P22415 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
USF1P22415 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF1P22415 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF1P22415 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF1P22415 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF1P22415 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF1P22415 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF1P22415 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF1P22415 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF1P22415 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF1P22415 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF1P22415 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF1P22415 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF1P22415 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF1P22415 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF1P22415 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF1P22415 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF1P22415 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
USF1P22415 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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