Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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