Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP4AP20648 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms