Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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CXCL3P19876 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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CXCL3P19876 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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CXCL3P19876 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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CXCL3P19876 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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CXCL3P19876 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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CXCL3P19876 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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CXCL3P19876 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CXCL3P19876 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CXCL3P19876 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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