Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms