Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPB42P16452 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPB42P16452 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPB42P16452 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPB42P16452 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPB42P16452 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPB42P16452 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPB42P16452 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPB42P16452 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EPB42P16452 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPB42P16452 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EPB42P16452 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPB42P16452 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPB42P16452 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPB42P16452 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPB42P16452 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPB42P16452 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPB42P16452 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPB42P16452 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPB42P16452 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPB42P16452 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPB42P16452 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPB42P16452 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPB42P16452 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPB42P16452 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPB42P16452 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPB42P16452 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPB42P16452 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPB42P16452 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPB42P16452 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPB42P16452 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPB42P16452 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPB42P16452 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPB42P16452 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPB42P16452 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPB42P16452 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPB42P16452 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPB42P16452 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPB42P16452 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPB42P16452 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPB42P16452 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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EPB42P16452 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPB42P16452 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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EPB42P16452 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPB42P16452 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPB42P16452 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPB42P16452 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPB42P16452 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPB42P16452 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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EPB42P16452 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPB42P16452 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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EPB42P16452 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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EPB42P16452 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPB42P16452 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPB42P16452 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPB42P16452 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPB42P16452 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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EPB42P16452 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPB42P16452 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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EPB42P16452 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPB42P16452 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPB42P16452 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPB42P16452 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPB42P16452 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPB42P16452 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPB42P16452 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EPB42P16452 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPB42P16452 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPB42P16452 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPB42P16452 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPB42P16452 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPB42P16452 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPB42P16452 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPB42P16452 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPB42P16452 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPB42P16452 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPB42P16452 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPB42P16452 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EPB42P16452 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPB42P16452 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPB42P16452 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPB42P16452 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPB42P16452 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPB42P16452 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms