Protein–RNA interactions for Protein: P12694

BCKDHA, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHAP12694 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDHAP12694 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms