Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAMC1P11047 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms