Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLK3P07288 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLK3P07288 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLK3P07288 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLK3P07288 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLK3P07288 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLK3P07288 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLK3P07288 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLK3P07288 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLK3P07288 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLK3P07288 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLK3P07288 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLK3P07288 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLK3P07288 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLK3P07288 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLK3P07288 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLK3P07288 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLK3P07288 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLK3P07288 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLK3P07288 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLK3P07288 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLK3P07288 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLK3P07288 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLK3P07288 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms