Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAVP06756 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms