Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGB2P05107 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms