Protein–RNA interactions for Protein: O94907

DKK1, Dickkopf-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK1O94907 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK1O94907 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK1O94907 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK1O94907 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK1O94907 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK1O94907 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK1O94907 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK1O94907 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK1O94907 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK1O94907 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK1O94907 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK1O94907 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK1O94907 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK1O94907 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK1O94907 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK1O94907 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK1O94907 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK1O94907 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK1O94907 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK1O94907 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK1O94907 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK1O94907 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK1O94907 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK1O94907 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK1O94907 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK1O94907 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK1O94907 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK1O94907 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK1O94907 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK1O94907 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK1O94907 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK1O94907 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK1O94907 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK1O94907 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK1O94907 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK1O94907 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK1O94907 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK1O94907 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK1O94907 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK1O94907 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK1O94907 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK1O94907 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK1O94907 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK1O94907 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK1O94907 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK1O94907 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK1O94907 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK1O94907 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK1O94907 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK1O94907 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK1O94907 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK1O94907 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK1O94907 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK1O94907 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK1O94907 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK1O94907 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK1O94907 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK1O94907 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK1O94907 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK1O94907 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK1O94907 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK1O94907 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK1O94907 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK1O94907 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK1O94907 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK1O94907 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK1O94907 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK1O94907 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK1O94907 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK1O94907 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK1O94907 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK1O94907 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK1O94907 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK1O94907 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK1O94907 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK1O94907 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK1O94907 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK1O94907 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK1O94907 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK1O94907 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK1O94907 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK1O94907 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK1O94907 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK1O94907 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK1O94907 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK1O94907 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK1O94907 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK1O94907 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK1O94907 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK1O94907 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK1O94907 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK1O94907 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK1O94907 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK1O94907 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK1O94907 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK1O94907 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK1O94907 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK1O94907 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK1O94907 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK1O94907 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.6 ms