Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNSO60931 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNSO60931 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNSO60931 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNSO60931 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNSO60931 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNSO60931 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNSO60931 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNSO60931 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNSO60931 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNSO60931 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNSO60931 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNSO60931 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNSO60931 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNSO60931 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNSO60931 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNSO60931 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNSO60931 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNSO60931 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNSO60931 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNSO60931 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNSO60931 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNSO60931 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNSO60931 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNSO60931 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNSO60931 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNSO60931 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNSO60931 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNSO60931 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNSO60931 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNSO60931 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNSO60931 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNSO60931 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNSO60931 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNSO60931 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNSO60931 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNSO60931 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNSO60931 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNSO60931 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNSO60931 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNSO60931 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNSO60931 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNSO60931 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNSO60931 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNSO60931 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNSO60931 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNSO60931 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNSO60931 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNSO60931 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNSO60931 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNSO60931 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNSO60931 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNSO60931 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNSO60931 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNSO60931 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNSO60931 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNSO60931 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNSO60931 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNSO60931 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNSO60931 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNSO60931 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNSO60931 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNSO60931 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNSO60931 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNSO60931 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNSO60931 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNSO60931 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNSO60931 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNSO60931 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNSO60931 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNSO60931 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNSO60931 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNSO60931 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTNSO60931 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNSO60931 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNSO60931 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNSO60931 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNSO60931 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNSO60931 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNSO60931 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNSO60931 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNSO60931 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNSO60931 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNSO60931 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNSO60931 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNSO60931 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNSO60931 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNSO60931 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNSO60931 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNSO60931 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNSO60931 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNSO60931 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNSO60931 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNSO60931 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNSO60931 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNSO60931 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNSO60931 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNSO60931 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNSO60931 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTNSO60931 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms