Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB3O43889 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB3O43889 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB3O43889 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB3O43889 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB3O43889 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB3O43889 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB3O43889 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB3O43889 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB3O43889 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB3O43889 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB3O43889 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB3O43889 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB3O43889 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CREB3O43889 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB3O43889 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB3O43889 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB3O43889 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB3O43889 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB3O43889 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB3O43889 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB3O43889 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB3O43889 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB3O43889 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB3O43889 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB3O43889 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB3O43889 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB3O43889 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB3O43889 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB3O43889 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB3O43889 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB3O43889 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB3O43889 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB3O43889 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB3O43889 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB3O43889 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB3O43889 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB3O43889 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB3O43889 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB3O43889 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB3O43889 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB3O43889 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB3O43889 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB3O43889 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB3O43889 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB3O43889 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB3O43889 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB3O43889 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB3O43889 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB3O43889 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB3O43889 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB3O43889 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB3O43889 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB3O43889 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB3O43889 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB3O43889 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB3O43889 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB3O43889 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB3O43889 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CREB3O43889 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CREB3O43889 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CREB3O43889 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CREB3O43889 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CREB3O43889 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CREB3O43889 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CREB3O43889 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CREB3O43889 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CREB3O43889 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CREB3O43889 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CREB3O43889 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CREB3O43889 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CREB3O43889 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CREB3O43889 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CREB3O43889 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CREB3O43889 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CREB3O43889 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CREB3O43889 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CREB3O43889 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CREB3O43889 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREB3O43889 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREB3O43889 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CREB3O43889 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREB3O43889 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREB3O43889 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREB3O43889 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CREB3O43889 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREB3O43889 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREB3O43889 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CREB3O43889 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREB3O43889 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREB3O43889 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREB3O43889 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREB3O43889 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREB3O43889 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREB3O43889 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREB3O43889 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREB3O43889 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREB3O43889 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREB3O43889 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CREB3O43889 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms