Protein–RNA interactions for Protein: O43281

EFS, Embryonal Fyn-associated substrate, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFSO43281 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFSO43281 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFSO43281 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFSO43281 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFSO43281 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFSO43281 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFSO43281 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFSO43281 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFSO43281 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFSO43281 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFSO43281 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFSO43281 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFSO43281 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFSO43281 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFSO43281 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFSO43281 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFSO43281 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFSO43281 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EFSO43281 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFSO43281 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EFSO43281 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFSO43281 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFSO43281 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFSO43281 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFSO43281 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFSO43281 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFSO43281 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFSO43281 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFSO43281 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EFSO43281 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EFSO43281 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EFSO43281 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFSO43281 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFSO43281 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFSO43281 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EFSO43281 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EFSO43281 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EFSO43281 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFSO43281 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EFSO43281 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFSO43281 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFSO43281 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFSO43281 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFSO43281 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFSO43281 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFSO43281 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFSO43281 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFSO43281 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFSO43281 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFSO43281 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFSO43281 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFSO43281 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFSO43281 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFSO43281 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFSO43281 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFSO43281 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFSO43281 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFSO43281 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFSO43281 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFSO43281 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFSO43281 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFSO43281 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EFSO43281 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFSO43281 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFSO43281 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EFSO43281 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFSO43281 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFSO43281 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFSO43281 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EFSO43281 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFSO43281 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFSO43281 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EFSO43281 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFSO43281 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFSO43281 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFSO43281 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFSO43281 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFSO43281 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFSO43281 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFSO43281 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFSO43281 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFSO43281 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFSO43281 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFSO43281 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFSO43281 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFSO43281 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFSO43281 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFSO43281 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFSO43281 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFSO43281 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFSO43281 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFSO43281 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFSO43281 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFSO43281 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFSO43281 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFSO43281 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFSO43281 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFSO43281 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFSO43281 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFSO43281 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms