Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FANCAO15360 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FANCAO15360 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FANCAO15360 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FANCAO15360 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FANCAO15360 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FANCAO15360 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FANCAO15360 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FANCAO15360 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FANCAO15360 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FANCAO15360 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FANCAO15360 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FANCAO15360 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FANCAO15360 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FANCAO15360 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FANCAO15360 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FANCAO15360 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FANCAO15360 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FANCAO15360 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FANCAO15360 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FANCAO15360 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FANCAO15360 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FANCAO15360 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FANCAO15360 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FANCAO15360 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FANCAO15360 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FANCAO15360 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FANCAO15360 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FANCAO15360 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FANCAO15360 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FANCAO15360 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FANCAO15360 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FANCAO15360 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FANCAO15360 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FANCAO15360 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FANCAO15360 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FANCAO15360 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FANCAO15360 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FANCAO15360 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FANCAO15360 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FANCAO15360 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FANCAO15360 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FANCAO15360 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FANCAO15360 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FANCAO15360 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FANCAO15360 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FANCAO15360 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FANCAO15360 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FANCAO15360 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FANCAO15360 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FANCAO15360 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FANCAO15360 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FANCAO15360 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FANCAO15360 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FANCAO15360 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FANCAO15360 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FANCAO15360 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FANCAO15360 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FANCAO15360 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FANCAO15360 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FANCAO15360 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FANCAO15360 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FANCAO15360 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FANCAO15360 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FANCAO15360 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FANCAO15360 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FANCAO15360 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FANCAO15360 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FANCAO15360 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FANCAO15360 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FANCAO15360 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FANCAO15360 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FANCAO15360 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FANCAO15360 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FANCAO15360 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FANCAO15360 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FANCAO15360 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FANCAO15360 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FANCAO15360 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FANCAO15360 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FANCAO15360 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FANCAO15360 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FANCAO15360 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FANCAO15360 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FANCAO15360 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FANCAO15360 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FANCAO15360 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FANCAO15360 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FANCAO15360 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FANCAO15360 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FANCAO15360 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FANCAO15360 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FANCAO15360 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FANCAO15360 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FANCAO15360 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FANCAO15360 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FANCAO15360 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FANCAO15360 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FANCAO15360 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FANCAO15360 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms