Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
E2F3O00716 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
E2F3O00716 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
E2F3O00716 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
E2F3O00716 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
E2F3O00716 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
E2F3O00716 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
E2F3O00716 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
E2F3O00716 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F3O00716 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F3O00716 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F3O00716 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F3O00716 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F3O00716 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F3O00716 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F3O00716 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F3O00716 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F3O00716 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F3O00716 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F3O00716 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F3O00716 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F3O00716 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F3O00716 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F3O00716 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F3O00716 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F3O00716 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F3O00716 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F3O00716 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F3O00716 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F3O00716 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F3O00716 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F3O00716 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F3O00716 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F3O00716 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F3O00716 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F3O00716 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F3O00716 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F3O00716 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F3O00716 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F3O00716 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F3O00716 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F3O00716 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F3O00716 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F3O00716 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F3O00716 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F3O00716 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F3O00716 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F3O00716 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F3O00716 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F3O00716 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F3O00716 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F3O00716 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F3O00716 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F3O00716 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F3O00716 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F3O00716 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F3O00716 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F3O00716 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F3O00716 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F3O00716 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F3O00716 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F3O00716 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F3O00716 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F3O00716 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F3O00716 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F3O00716 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F3O00716 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F3O00716 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F3O00716 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F3O00716 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F3O00716 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F3O00716 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F3O00716 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F3O00716 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F3O00716 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F3O00716 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F3O00716 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F3O00716 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F3O00716 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F3O00716 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F3O00716 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F3O00716 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F3O00716 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F3O00716 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F3O00716 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F3O00716 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F3O00716 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F3O00716 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F3O00716 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F3O00716 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F3O00716 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F3O00716 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F3O00716 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F3O00716 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F3O00716 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F3O00716 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F3O00716 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F3O00716 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F3O00716 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F3O00716 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms