Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms