Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
B4DXG7 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DXG7 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DXG7 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DXG7 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DXG7 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DXG7 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DXG7 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DXG7 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DXG7 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DXG7 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DXG7 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DXG7 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DXG7 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DXG7 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DXG7 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DXG7 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DXG7 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DXG7 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DXG7 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DXG7 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DXG7 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DXG7 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DXG7 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DXG7 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DXG7 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DXG7 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DXG7 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DXG7 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DXG7 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DXG7 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DXG7 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DXG7 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DXG7 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DXG7 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DXG7 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DXG7 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DXG7 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DXG7 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DXG7 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DXG7 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DXG7 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DXG7 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DXG7 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DXG7 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DXG7 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DXG7 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
B4DXG7 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DXG7 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DXG7 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DXG7 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DXG7 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DXG7 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DXG7 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DXG7 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DXG7 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DXG7 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DXG7 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DXG7 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DXG7 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DXG7 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DXG7 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DXG7 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DXG7 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DXG7 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DXG7 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DXG7 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DXG7 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DXG7 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DXG7 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DXG7 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DXG7 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DXG7 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DXG7 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DXG7 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DXG7 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DXG7 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DXG7 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DXG7 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DXG7 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DXG7 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DXG7 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DXG7 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DXG7 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DXG7 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms