Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GMNCA6NCL1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMNCA6NCL1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms