Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XIRP2A4UGR9 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XIRP2A4UGR9 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms