Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRAMEF22A3QJZ6 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms